Marienorgel
Die Marienorgel befindet sich im nördlichen Querhaus und ist das größte Instrument im Orgelquartett. Sie wurde 1965 durch die österreichische Firma Rieger Orgelbau aus Schwarzach in Vorarlberg erbaut.


| I. Positiv (C-g''') | II. Hauptwerk (C-g''') | III. Schwellwerk (C-g''') |
| 1. Prinzipal 8' | 11. Prinzipal 16' | 24. Gedacktpommer 16' |
| 2. Metallgedackt 8' | 12. Oktave 8' | 25. Holzprinzipal 8' |
| 3. Prinzipal 4' | 13. Rohrflöte 8' | 26. Spillpfeife 8' |
| 4. Rohrflöte 4' | 14. Spitzflöte 4' | 27. Gamba 8' (2001) |
| 5. Gemshorn 2' | 15. Oktave 4' | 28. Voix céleste 8' (2001) |
| 6. Gemsquinte 1 ⅓' | 16. Spitzquinte 2 ⅔' | 29. Oktave 4' |
| 7. Sesquialtera 2f. 2 ⅔' | 17. Oktave 2' | 30. Querflöte 4' |
| 8. Scharf 4-6f. 1' (V) | 18. Mixtur 5f. 2' (V) | 31. Viola 4' (2001) |
| 9. Dulzian 16' | 19. Zimbel 3f. ½' (V) | 32. Nasat 2 ⅔' |
| 10. Krummhorn 8' (1990) | 20. Kornett 5f. ab fs 8' | 33. Flautino 2' |
| - Tremulant - | 21. Trompete 16' (2021) | 34. Terz 1 ⅗' |
| | 22. Trompete 8' (2021) | 35. Mixtur 4f. 1 ⅓' (V) |
| | 23. Klarine 4' | 36. Fagott 16' |
| | | 37. Trompete 8' |
| IV. Brustwerk (C-g''') | Pedal (C-f') | 38. Oboe 8' |
| 41. Holzgedackt 8' | 50. Prinzipalbass 16' | 39. Klarine 4' |
| 42. Blockflöte 4' | 51. Subbass 16' | 40. Glockenspiel c'-d''' (2001) |
| 43. Prinzipal 2' | 52. Oktavbass 8' | - Tremulant - |
| 44. Gedacktflöte 2' | 53. Gedacktbass 8' | |
| 45. Terzian 1 ⅗' + 1 ⅓' | 54. Quintbass 5 ⅓' (V) | |
| 46. Oktave 1' | 55. Oktave 4' | |
| 47. Glockenzimbel 2f. ½' | 56. Koppelflöte 4' | |
| 48. Vox humana 8' | 57. Nachthorn 2' | |
| 49. Cembalo-Regal 4' | 58. Mixtur 6f. 2 ⅔' | |
| - Tremulant - | 59. Kontrafagott 32' (1978) | |
| | 60. Posaune 16' (2021) | |
| | 61. Trompete 8' (2021) | |
| | 62. Zink 4' | |
| | - Tremulant Kleinpedal - | |

Matthias Maierhofer an der Marienorgel (Rieger, 1965 / 2001 / 2017) im Freiburger Münster.
Deutsch-Englisches Booklet mit Texten von Prof. Dr. Meinrad Walter (zum Programm) und Dr. Jan Kühle (zur Orgel).
CD 2 der fünfteiligen CD-Reihe von Domorganist Professor Matthias Maierhofer aus dem Freiburger Münster. Es erklingen Werke von Johann Sebastian Bach.
| I. Positiv (C-g''') | II. Hauptwerk (C-g''') | III. Schwellwerk (C-g''') |
| 1. Prinzipal 8' | 11. Prinzipal 16' | 24. Gedacktpommer 16' |
| 2. Metallgedackt 8' | 12. Oktave 8' | 25. Holzprinzipal 8' |
| 3. Prinzipal 4' | 13. Rohrflöte 8' | 26. Spillpfeife 8' |
| 4. Rohrflöte 4' | 14. Spitzflöte 4' | 27. Unda maris 8' |
| 5. Gemshorn 2' | 15. Oktave 4' | 28. Oktave 4' |
| 6. Gemsquinte 1 1/3' | 16. Spitzquinte 2 2/3' | 29. Querflöte 4' |
| 7. Sesquialtera 2f. 2 2/3' | 17. Oktave 2' | 30. Nasat 2 2/3' |
| 8. Scharf 4-6f. 1' | 18. Mixtur 8f. 2' | 31. Flautino 2' |
| 9. Dulzian 16' | 19. Zimbel 3f. 1/2' | 32. Terz 1 3/5' |
| 10. Schalmay 8' | 20. Kornett 5f. 8' | 33. Obertöne 1 3/5', 1 1/3', |
| - Tremulant - | 21. Trompete 16' | 8/9', 8/15' |
| 22. Trompete 8' | 34. Mixtur 5-7f. 1 1/3' | |
| | 23. Klarine 4' | 35. Terzzymbel 3f. 1/6', 1/8', 1/10' |
| | 36. Fagott 16' | |
| IV. Brustwerk (C-g''') | Pedal (C-f') | 37. Trompete 8' |
| 40. Holzgedackt 8' | 49. Prinzipalbass 16' | 38. Oboe 8' |
| 41. Blockflöte 4' | 50. Subbass 16' | 39. Klarine 4' |
| 42. Prinzipal 2' | 51. Oktavbass 8' | - Tremulant - |
| 43. Gedacktflöte 2' | 52. Gedacktbass 8' | |
| 44. Terzian 1 3/5' + 1 1/3' | 53. Oktave 4' | |
| 45. Oktave 1' | 54. Koppelflöte 4' | |
| 46. Glockenzimbel 3f. 1/2', 8/19', 1/3' | 55. Nachthorn 2' | |
| 47. Vox humana 8' | 56. Rauschpfeife 3f. 5 1/3', | |
| 48. Cembalo-Regal 4' | 3 1/5', 2 2/7' | |
| - Tremulant - | 57. Mixtur 6f. 2 2/3' | |
| 58. Kontrafagott 32' | | |
| | 59. Posaune 16' | |
| | 60. Trompete 8' | |
| | 61. Zink 4' | |
| | - Tremulant Kleinpedal - | |
| I. Hauptwerk (C-c4) | II. Oberwerk (C-c4) | III. Schwellwerk (C-c4) | Pedal (C-g3) |
| 1. Principal 16' neu | 15. Quintatön 16' | 27. Liebl. Gedackt 16' | 45. Principal 16' |
| 2. Principal 8' neu | 16. Geigenprincipal 8' | 28. Principal 8' | 46. Subbaß 16' |
| 3. Gedacktpommer 8' | 17. Salicional 8' | 29. Viola da gamba 8' | 47. Zartbaß 16' (Tr. 27) |
| 4. Gemshorn 8' | 18. Rohrgedackt 8' | 30. Unda maris 8' | 48. Oktavbaß 8' (E. 45) |
| 5. Gamba 8' | 19. Blockflöte 4' | 31. Quintatön 8' | 49. Gedacktbaß 8' (Tr. 27) |
| 6. Rohrflöte 4' | 20. Octave 4' | 32. Bordun 8' (E. 27) | 50. Choralbaß 4' |
| 7. Oktav 4' | 21. Waldflöte 2' | 33. Oktave 4' | 51. Flötbaß 4' |
| 8. Quinte 2 2/3' | 22. Terz 1 3/5' | 34. Spitzflöte 4' | 52. Flöte 2' (E. 51) |
| 9. Oktav 2' | 23. Sifflöte 1' | 35. Quinte 2 2/3' | 53. Mixtur 5-7f. 5 1/3' |
| 10. Cornett 3-4f. 2 2/3' | 24. Scharf 4-5f. 1' | 36. Bachflöte 2' | 54. Contra Tuba 32' (**) |
| 11. Mixtur 4-6f. 2' | 25. Rankett 8' | 37. Octavin 2' | 55. Posaune 16' |
| 12. Scharfcymbel 5f. 2/3' | 26. Oboe 8' | 38. Superquinte 1 1/3' | 56. Trompete 8' (E. 55) |
| 13a. Trompete 16' (*) | - Tremolo - | 39. Schwiegel 1' | 57. Dulzian 8' |
| 13. Trompete 8' | 40. Mixtur 5-7f. 1 1/3' | 58. Clairon 4' | |
| 14. Clairon 4' | 41. Cimbel 3f. 1/6' | 59. Singend Cornett 2' | |
| 42. Basson 16' | |||
| 43. Trompette harm. 8' | |||
| 44. Krummhorn 4' | |||
| - Tremolo - |
| I. Hauptwerk (C-c4) | II. Oberwerk (C-c4) | III. Schwellwerk (C-c4) | Pedal (C-g3) |
| 1. Principal 16' | 15. Quintatön 16' | 27. Liebl. Gedackt 16' | 45. Principal 16' |
| 2. Principal 8' | 16. Geigenprincipal 8' | 28. Principal 8' | 46. Subbaß 16' |
| 3. Gedacktpommer 8' | 17. Salicional 8' | 29. Flaut amabile 8' | 47. Zartbaß 16' (Tr. 27) |
| 4. Gemshorn 8' | 18. Rohrgedackt 8' | 30. Flötenschwebung 8' | 48. Quintbaß 10 2/3' |
| 5. Gamba 8' | 19. Blockflöte 4' | 31. Quintatön 8' | 49. Oktavbaß 8' (E. 45) |
| 6. Rohrflöte 4' | 20. Octave 4' | 32. Bordun 8' (E. 27) | 50. Gedacktbaß 8' (Tr. 27) |
| 7. Oktav 4' | 21. Waldflöte 2' | 33. Oktave 4' | 51. Quintbaß 5 1/3' (E. 48) |
| 8. Quinte 2 2/3' | 22. Terz 1 3/5' | 34. Hornflöte 4' | 52. Choralbaß 4' |
| 9. Super Oktav 2' | 23. Sifflöte 1' | 35. Sesquialter 2f. | 53. Pedalcornett 4f. |
| 10. Cornett 3-4f. 2 2/3' | 24. Scharfmixtur 3f. 2/3' | 36. Bachflöte 2' | 54. Contra Tuba 32' (*) |
| 11. Mixtur 4-6f. 2 2/3' | 25. Rankett 8' | 37. Septime 1 1/7' | 55. Posaune 16' |
| 12. Scharfcymbel 5f. 2/3' | 26. Englisch Horn 4' | 38. Quinte 1 1/3' | 56. Trompete 8' (E. 55) |
| 13. Trompete 8' | - Tremolo - | 39. Schwiegel 1' | 57. Dulzian 8' |
| 14. Clairon 4' | 40. Zimbel 4f. 1/4' | 58. Trompete 4' (E. 55) | |
| 41. Basson 16' | 59. Singend Cornett 2' | ||
| 42. Oboe 8' | |||
| 43. Trompette harm. 8' | |||
| 44. Geigenregal 4' | |||
| - Tremolo - |
| Hauptwerk (C-g''') | 1. Nebenwerk (C-g''') | 2. Nebenwerk (C-g''') | Pedal (C-d') | |||||||
| Bordun | 16' | Principal | 8' | Geigenprincipal | 8' | Contra-Violon | 32' | |||
| Principal | 8' | Dolce | 8' | Lieblich Gedeckt | 8' | Principalbaß | 16' | |||
| Gamba | 8' | Salicional | 8' | Harmonica | 8' | Violonbaß | 16' | |||
| Manualflöte | 8' | Gedeckt | 8' | Dulcian (lab.) | 4' | Subbaß | 16' | |||
| Gemshorn | 8' | Gemshorn | 4' | Waldflöte | 2' | Octavbaß | 8' | |||
| Fugara | 8' | Querflöte | 4' | Physharmonica | 8' | Flötbaß | 8' | |||
| Bordun | 8' | Flautino | 2' | Posaunbaß | 16' | |||||
| Quintflöte | 5 1/3' | Mixtur 4f. | 2 2/3' | Trompetenbaß | 8' | |||||
| Octav | 4' | Fagott-Clarinette | 8' | |||||||
| Rohrflöte | 4' | |||||||||
| Teutsche Flöte | 4' | |||||||||
| Superoctav | 2' | |||||||||
| Mixtur 5f. | 2 2/3' | |||||||||
| Trompete | 8' |